SS-Führungshauptamt, yang berada di bawah arahan terus Reichsführer-SS Heinrich Himmler, telah ditubuhkan pada tahun 1940 dari beberapa jabatan dalam SS-Hauptamt dan Allgemeine SS. Tugas utamanya adalah mengawal operasi Waffen-SS membangunkan dasar umum mengenai rekrut dan mengendalikan keperluan kakitangan khas. Menjelang tahun 1942, pengambilan oleh Allgemeine SS telah hampir berhenti akibat Perang Dunia II, bermakna unit tempatan bertanggungjawab untuk mengekalkan tahap kakitangan mereka sendiri.

SS-FHA mempunyai keutamaan ke atas semua cawangan lain Angkatan Tentera dalam pemilihan rekrut. Begitu juga, untuk memenuhi kadar kasualti dan pengembangan divisyen medan Waffen-SS, perkhidmatan dalam Waffen-SS telah diwajibkan kepada semua ahli-ahli Allgemeine-SS pada tahun 1941. SS-FHA juga menerima kakitangan yang memohon pemindahan secara sukarela ke Waffen-SS selepas dimasukkan ke dalam mana-mana cawangan lain tentera Nazi Jerman; ini kemudian termasuk ahli-ahli Belia Hitler. Apabila Himmler meletak jawatan sebagai Ketua SS-FHA pada tahun 1943, SS-Obergruppenführer Hans Jüttner mengambil alih jawatan sehingga akhir perang.